G.Saray’da, Marcelo Saracchi’nin transfer edilmesi sonrası yabancı kontenjanın da dolmasıyla kadro dışı kalan Yuto Nagatomo, ülkesine dönme kararı aldı.
Ara transferde İtalya Serie A ekibi Bologna ile anlaşamayan Japon futbolcu, eski takımı FC Tokyo ile masaya oturdu. Japon ekibinin, 33 yaşındaki eski futbolcusunun transferi için görüştüğü ve prensipte anlaşıldığı öğrenildi.
2017-2018 sezonunun devre arasında Galatasaray'a kiralık olarak transfer olan Yuto Nagatomo'nun 2018-2019 yaz transfer döneminde bonservisi alınmıştı. Sarı-kırmızılı formayla mücadele ettiği 2 yılda içerisinde iki Süper Lig, bir Türkiye Kupası ve bir Süper Kupa kazanma başarısı gösteren Japon futbolcu, çıktığı 65 maçta 3 gol ve 7 asistlik performans sergiledi. Bu sezonun ilk devresinde Galatasaray formasıyla 24 maça çıkan Nagatomo, 2 gol atmış hiç asist yapamamıştı.